当运费发票到达晚于采购发票时，您可以按照以下步骤进行结算：

运费发票后到如何结算

费用折扣结算

在软件中选择“采购结算”--“费用折扣结算”。

选择对应的入库单、采购发票和运费发票。

点击“分摊”，将运费发票的费用按金额或数量分摊进存货成本。

点击“结算”完成分摊操作。

结算成本处理

在月末准备月结时，进行正常单据记账。

记完账后，选择“结算成本处理”按钮。

输入分摊给这两笔入库单的金额。

选择“暂估”，系统将生成一张入库调整单，完成结算。

账务处理

支付运费的分录：

```

借：预付账款

贷：银行存款

```

收到运费发票的分录：

```

借：销售费用/管理费用---运费

应交税费---应交增值税--运费进项税

贷：预付账款

```

以上步骤可以帮助您处理运费发票后到的结算问题。