高校横向课题的缴税流程如下：

发票开具与税费缴纳

已预开发票：在课题立项前若已预开发票，项目负责人需同时提交缴税的校内结算单。财务处在立项时会将课题负责人前期垫付的税款直接转入其工资卡。

未开票：若课题立项时尚未开票，项目负责人需提交项目合同（复印件）及免税课题所需的技术合同认定证明。财务处在立项时会直接开具税务发票，并从项目经费中扣缴相关税费。增值税普通发票将以电子形式发送至票据接收人邮箱，增值税专用发票则需要项目负责人与财务处开票人员电话沟通纸质发票的领取时间。

适用税率

小规模纳税人：若学校被认定为小规模纳税人，综合税率为3.27%，其中包括增值税、城建税、教育费附加及地方教育费附加。增值税由国税局征收，其余部分由地税局征收。

一般纳税人：若学校为一般纳税人，适用的增值税税率可能为6%。项目负责人需分项目核算，并计算、缴纳每个项目的每月增值税。

印花税

签订横向课题合同后，项目负责人需在合同签订日期的次月16日前到税务大楼缴纳印花税。若需财务处代缴，则需在次月10日前将合同复印件交至指定地点。

个人所得税

科研奖励作为工资、薪金所得，需缴纳个人所得税。计算应纳税所得额时，可扣除免征额和专项附加扣除，然后根据适用税率表计算应纳税额，并减去速算扣除数得出最终应缴纳的个人所得税。具体操作中可以由单位代扣代缴，也可以自行到税务机关申报缴纳。

建议：

课题负责人应提前了解并确认学校的纳税人身份及适用税率，以确保正确开具发票和缴纳税款。

留意税务申报截止日期，确保按时完成各项税务手续，避免产生滞纳金和罚款。

若有疑问或需要协助，可联系学校的财务处或税务顾问获取详细指导和帮助。